Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sft2d1Q5SSN7 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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