Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms