Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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