Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ptchd1Q14B62 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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