Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpusd3Q14AI6 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpusd3Q14AI6 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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