Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd1Q01822 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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