Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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