Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PtprmP28828 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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