Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RxraP28700 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RxraP28700 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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