Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms