Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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