Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nedd9O35177 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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