Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Tmem200cJ3QK46 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tmem200cJ3QK46 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tmem200cJ3QK46 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Tmem200cJ3QK46 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Tmem200cJ3QK46 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tmem200cJ3QK46 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Tmem200cJ3QK46 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.9 ms