Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms