Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms