Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Ptprz1B9EKR1 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms