Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Spocd1B1ASB6 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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