Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Grik3B1AS29 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.8 ms