Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cln8Q9QUK3 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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