Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1Q9JM13 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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