Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gde1Q9JL56 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Gde1Q9JL56 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms