Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp29Q9ES63 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp29Q9ES63 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms