Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Cldn22Q9D7U6 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Cldn22Q9D7U6 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Cldn22Q9D7U6 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Cldn22Q9D7U6 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn22Q9D7U6 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.6 ms