Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Zbed3Q9D0L1 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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