Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc47Q9D024 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc47Q9D024 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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