Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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Sgo1Q9CXH7 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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Sgo1Q9CXH7 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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Sgo1Q9CXH7 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sgo1Q9CXH7 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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