Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Krt40Q6IFX3 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Krt40Q6IFX3 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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