Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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