Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Usp39Q3TIX9 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp39Q3TIX9 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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