Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim71Q1PSW8 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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