Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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ptchd1Q14B62 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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ptchd1Q14B62 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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ptchd1Q14B62 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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ptchd1Q14B62 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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ptchd1Q14B62 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ptchd1Q14B62 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms