Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtbP53612 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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