Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Rpl28P41105 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Rpl28P41105 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms