Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PtprmP28828 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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