Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RxraP28700 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RxraP28700 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RxraP28700 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RxraP28700 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RxraP28700 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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