Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
Hoxd12P23812 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd12P23812 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms