Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PrkcaP20444 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms