Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NefhP19246 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NefhP19246 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NefhP19246 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NefhP19246 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NefhP19246 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NefhP19246 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NefhP19246 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.3 ms