Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Hoxd4P10628 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Hoxd4P10628 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd4P10628 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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