Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
P10404 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
P10404 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
P10404 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
P10404 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
P10404 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
P10404 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
P10404 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
P10404 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
P10404 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
P10404 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
P10404 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
P10404 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
P10404 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
P10404 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
P10404 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
P10404 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
P10404 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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