Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Nedd9O35177 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Nedd9O35177 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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