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| Pitx3 | O35160 | Gm14269-201 | ENSMUST00000120455 | 306 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm15327-202 | ENSMUST00000153958 | 467 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm25393-201 | ENSMUST00000157336 | 285 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm17100-201 | ENSMUST00000168963 | 272 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm26870-201 | ENSMUST00000181242 | 1170 nt | TSL 5 BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| Pitx3 | O35160 | 1810026B05Rik-201 | ENSMUST00000183916 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
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| Pitx3 | O35160 | AC154552.5-201 | ENSMUST00000222352 | 207 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Gm6358-201 | ENSMUST00000089101 | 156 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 0.09 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Sycp1-ps1-201 | ENSMUST00000207882 | 2768 nt | BASIC | 0.08 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | AC120383.1-201 | ENSMUST00000221123 | 573 nt | TSL 3 BASIC | 0.08 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Ptp4a1-206 | ENSMUST00000202889 | 135 nt | TSL 2 BASIC | 0.06 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Gm23645-201 | ENSMUST00000083228 | 108 nt | BASIC | 0.06 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Gm26263-201 | ENSMUST00000083281 | 164 nt | BASIC | 0.06 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Olfr937-202 | ENSMUST00000215049 | 2259 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Sult2a-ps3-201 | ENSMUST00000117899 | 428 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Gm27289-201 | ENSMUST00000183341 | 82 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Mir6355-201 | ENSMUST00000183687 | 106 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm29022-201 | ENSMUST00000190702 | 225 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Igkv13-82-201 | ENSMUST00000200308 | 346 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm43004-201 | ENSMUST00000201872 | 703 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm43898-201 | ENSMUST00000204456 | 424 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Serf1-201 | ENSMUST00000022145 | 601 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm31447-201 | ENSMUST00000222345 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm23924-201 | ENSMUST00000082474 | 108 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm24018-201 | ENSMUST00000083232 | 107 nt | BASIC | 0.05 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | AC127302.3-201 | ENSMUST00000215480 | 2791 nt | BASIC | 0.04 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm15177-201 | ENSMUST00000120491 | 577 nt | BASIC | 0.04 | □□□□□ -2.4 | | |
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| Pitx3 | O35160 | Gm24773-201 | ENSMUST00000158513 | 99 nt | BASIC | 0.04 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | 9230113P08Rik-202 | ENSMUST00000176153 | 414 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 0.04 | □□□□□ -2.4 | | |
| Pitx3 | O35160 | Gm10717-206 | ENSMUST00000177875 | 675 nt | TSL 5 BASIC | 0.04 | □□□□□ -2.4 | | |