Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.1 ms