Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NebE9Q1W3 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NebE9Q1W3 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NebE9Q1W3 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms