Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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Zfp558E9Q1J0 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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Zfp558E9Q1J0 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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Zfp558E9Q1J0 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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Zfp558E9Q1J0 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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Zfp558E9Q1J0 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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Zfp558E9Q1J0 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Zfp558E9Q1J0 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms