Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms