Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ccdc6D3YZP9 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc6D3YZP9 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc6D3YZP9 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc6D3YZP9 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc6D3YZP9 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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