Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rexo5D3YW29 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.3 ms