Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Spocd1B1ASB6 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms