Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Grik3B1AS29 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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